傳染病醫(yī)院（含帶傳染病房綜合醫(yī)院）應設專用化糞池。被傳染病病原體污染的傳染性污染物，如含糞便等排泄物，必須按我國衛(wèi)生防疫的有關規(guī)定進行嚴格消毒。消毒后的糞便等排泄物應單獨處置或排入專用化糞池，其上清液進入醫(yī)院污水處理系統(tǒng)。 不設化糞池的醫(yī)院應將經過消毒的排泄物按醫(yī)療廢物處理。
新（改、擴）建醫(yī)院，在設計醫(yī)院污水處理系統(tǒng)時應考慮將醫(yī)院病區(qū)、非病區(qū)、傳染病房、非傳染病房污水分別收集。現(xiàn)有醫(yī)院應盡可能將受傳染病病原體污染的污水與其他污水分別收集。特殊性質污水（如含重金屬廢水、含油廢水、洗印廢水等）應單獨收集，經預處理后與醫(yī)院污水合并處理，不得將特殊性質污水隨意排入下水道。
放射科廢水、感光廢水，由專業(yè)公司回收處理。放射科其他廢水經過衰減池靜置2個月后方可排入綜合污水處理系統(tǒng)。
傳染病醫(yī)療廢水處理設備二級處理：二級處理工藝流程為“格柵→預曝氣調節(jié)池→新型UBR系統(tǒng)→接觸消毒”。醫(yī)院污水通過化糞池進入預曝氣調節(jié)池。預曝氣調節(jié)池前部設置自動格柵。調節(jié)池內設提升水泵，污水經提升后進入新型UBR系統(tǒng)進行生物處理和污泥沉淀，出水進入接觸池消毒，出水達標排放。
